제품/서비스

미생물동정 (16S/18S/26S rRNA & ITS Region Full Sequencing)
  • 결과 정확성 : 99%
  • 경제적 비용으로 colony 분석
  • 다양한 Bioinformatics 분석서비스 지원 : align, blast, phylogenetic tree
  • SAS (SolGent Analysis Services) 웹 시스템을 기반으로 “미생물동정 주문 ~ 결과 확인”까지 실시간 모니터링 가능

미생물 동정 서비스는 원핵 세포 미생물 (Bacteria…)과 진핵 세포 미생물 (Yeast, Fungi…)의 ribosomal RNA 유전자 염기서열을 분석 후
GeneBank Database와 상동성을 비교하여 미생 물 종을 분류 및 동정 하는 서비스 입니다.

미생물 동정을 위한 ribosomal RNA 유전자
원핵 세포 미생물 진핵 세포 미생물
분석 유전자 16S rRNA
ITS (18S rRNA)
크기 1.5 kb 600 ~ 800 bp
솔젠트 보유 미생물동정 primer 27F, 337F, 518F, 785F, 518R, 783R, 805R, 1492R ITS1, ITS4
Sample 준비방법
Sample 종류 준비방법 비고
비 병원성균 순수 배양한 colony, Genomic DNA Sample 배송 : 4℃ 배송 추천, 겨울철엔 상온 배송 가능
Doubling time이 짧은 미생물은 여름철 상온 배송 시 오염의 가능성이 높습니다.)

곰팡이와 방선균은 포자에 의한 연구소 내 오염을 방지하기 위해서 gDNA 상태로 준비해 주세요.
병원성균, 곰팡이, 방선균 Genomic DNA
분석과정
  • Sample 보관기간 : 2주
  • 미생물동정 결과 보관기간 : 6개월
Bioinformatics 분석 서비스

기본적인 sequencing 결과 외, 별도 추가 시 Contig align, BlastN search, Phylogenetic tree 서비스를 제공합니다. (비용 부가) Phylogenetic tree (계통수)는 각 유사한 서열들과 어느 정도 진화적 거리가 있는지를 한 눈에 알아볼 수 있는 그림으로, Clustal W 프로그램을 사용하여 다중염기서열을 비교합니다. 솔젠트는 distance method (UPGMA & Neighbor Joining)와 type of tree (Phylogram & Cladogram)를 교차한 총 4가지 형태의 phylogenetic tree를 제공합니다.

  • 결과 Data 형식

    Contig align : contigs 파일 (메모장, 워드 등과 같은 문서 편집 프로그램 이용)
    BlastN search : html 파일
    Phylogenetic tree : html 파일